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Título: HADOOP E MAPREDUCE NO CONTEXTO DE APLICAÇÕES DE ANÁLISE DE DADOS PARA BIOTECNOLOGIA
Aluno: VITOR ROCHA CASTRO PEREIRA
Orientador: GUILHERME DE CLEVA FARTO
Banca: LUIZ CARLOS BEGOSSO
Ano: 2016 Tipo: Monografia / TCC
Palavras-chave: Hadoop, MapReduce, GenBank, sequências genéticas, padrões genéticos.
Resumo: A bioinformática é uma área que vem tendo uma grande evolução nos últimos anos. A quantidade de dados armazenados em um banco de dados genômico disponibilizado na Web, cresce cada vez mais conforme os cientistas avançam nas pesquisas a respeito do mapeamento de códigos genéticos. Ferramentas são propostas e desenvolvidas para realizar buscas nas bases de dados genéticos, com o objetivo de realizar comparações entre sequências para definir se há heranças ou semelhanças quando comparadas a outros tipos de organismos. O objetivo desta pesquisa é o de investigar a adoção de conceitos de Hadoop e MapReduce junto ao repositório GenBank, fornecendo uma nova abordagem para a busca e análise de padrões em sequências genéticas disponibilizadas na Web. Dessa forma, espera-se experimentar os recursos das tecnologias adotadas, Hadoop e MapReduce, na busca e identificação de padrões nas sequências. Esta pesquisa foi feita em artigos científicos sites e blogs relacionados a plataforma Hadoop e ao GenBank para poder obter-se informações de como integrar esta plataforma ao ambiente de Biotecnologia e realizar pesquisas nas bases de dados retornando somente as bases que possuem uma determinada cadeia genética.
